
Manuel Pasqual začal svoji kariéru v mládežnických týmech Regginy, v sedmnácti letech poprvé v dresu Derthony v Serii D nakoukl mezi dospělé. O rok později se stěhoval do Pordenone, taktéž v Serii D, kde na sebe upozornil. Všimlo si jej tam Treviso, tehdy hrající Serii C1, a angažovalo jej. Manuel však nedostával příliš prostoru a během prvního půlroku odehrál jen dva zápasy.
V lednu 2002 si jej koupilo Arezzo, které hrálo stejnou soutěž jako Treviso a Manuel zde na jaře odehrál 10 zápasů. V další sezoně se pak již natrvalo zabydlel na levém kraji obrany a pravidelně patřil k nejlepším hráčům. V sezoně 2003/04 se tým probojoval do Serie B a Manuel Pasqual patřil k vůbec nejlepším hráčům soutěže. Nebylo se čemu divit, když kolem něj začaly kroužit věhlasnější kluby.
V roce 2005 jej koupila Fiorentina, která potřebovala po odchodu Chielliniho posilu na levou stranu obrany. Zpočátku se střídal s Pancarem ale postupně si získal důvěru trenéra Prandelliho, a vytlačil Pancara na lavičku. Přesnými centry se z velké části podílel na vynikající sezoně Luky Toniho.
V březnu 2006 se Manuel Pasqual poprvé představil v dresu Squadry Azzurry. Ve Fiorentině, navzdory někdy nevyrovnaným výkonů, již delši dobu vládné pozici levého beka. Mimo jiné se v klubu objevili Potenza, Brivio či Balzaretti, ani jeden z nich ale Manuelovu pozici neohrozil a dříve nebo později z Fiorentiny odešel.
Dvakrát Manuel Fiorentině přispěl ke konečnému čtvrtému místu v Serii A, podílel se také na úspěšných taženích Pohárem UEFA a Ligou Mistrů.
| Sezona | Klub | Soutěž | Zápasy | Góly |
| 2011/2012 | Fiorentina | Serie A | 15 | 0 |
| 2010/2011 | Fiorentina | Serie A | 34 | 1 |
| 2009/2010 | Fiorentina | Serie A | 21 | 0 |
| 2008/2009 | Fiorentina | Serie A | 19 | 1 |
| 2007/2008 | Fiorentina | Serie A | 29 | 0 |
| 2006/2007 | Fiorentina | Serie A | 34 | 0 |
| 2005/2006 | Fiorentina | Serie A | 35 | 0 |
| 2004/2005 | Arezzo | Serie B | 39 | 0 |
| 2003/2004 | Arezzo | Serie C1 | 28 | 1 |
| 2002/2003 | Arezzo | Serie C1 | 31 | 1 |
| 2001/2002 | Arezzo | Serie C1 | 10 | 1 |
| 2001/2002 | Treviso | Serie C1 | 2 | 0 |
| 2000/2001 | Pordenone | Serie D | 30 | 1 |
| 1999/2000 | Derthona | Serie D | 15 | 0 |
| Celkem | Serie A | (7 sezon) | 187 | 2 |
| Celkem | Fiorentina | (7 sezon) | 187 | 2 |